RESEARCH JOURNAL
云计算与研究数据文章
从科研计算、生物信息学、AI 文献整理、数据格式到跨区域团队协作,按真实任务组织九篇首发内容。
01长篇报告
从输入数据到可复现结果:云端生物信息学任务完整工作流
重点讨论先把研究问题写成可计算任务、输入数据必须带着来源一起进入云端。
约 12 分钟02表达数据RNA-seq 表达矩阵为什么不能直接拿来比较
重点讨论原始计数记录的是观察量、极端高表达会改变整体比例。
约 8 分钟03AI 与研究AI 辅助文献整理,怎样避免生成不存在的研究结论
重点讨论先定义 AI 在流程中的角色、摘要不能代替方法与结果。
约 8 分钟04云计算CPU、GPU、内存与存储:科研任务到底需要什么资源
重点讨论CPU 适合大量通用计算、GPU 擅长特定并行任务。
约 8 分钟05数据格式GMT、R、JSON 与 XML:研究文件格式怎样选择
重点讨论GMT 适合交换基因集合、R 对象保留分析结构。
约 6 分钟06团队协作跨区域研究团队怎样交接大型数据集
重点讨论先确定交付对象、用固定索引代替聊天附件。
约 6 分钟07设备迁移换电脑后恢复云端研究环境,哪些内容不会自动回来
重点讨论先恢复账号与验证方式、远程密钥不会由浏览器自动同步。
约 6 分钟08可视化一张热图可以说明什么,又不能说明什么
重点讨论颜色来自数值映射、筛选规则改变图中故事。
约 4 分钟09复现与审计研究任务完成后,怎样留下可复查的运行记录
重点讨论记录任务身份、保存输入清单。
约 6 分钟